1. Rute Pulau Jawa
Jakarta – Yogyakarta (via Tol Trans Jawa)
Jakarta – Pejagan – Bumiayu – Kebumen – Kutoarjo – Purworejo – Yogyakarta
Jakarta – Cirebon – Semarang – Klaten – Yogyakarta
Jakarta – Semarang – Salatiga – Boyolali – Klaten – Yogyakarta
Jakarta – Solo (via Tol Trans Jawa)
Jakarta – Cirebon – Semarang – Salatiga – Solo
Jakarta – Surabaya
2. Via Pantura:
Jakarta – Tegal – Pemalang – Pekalongan – Kendal – Semarang – Demak – Kudus – Pati – Tuban – Lamongan – Gresik – Surabaya
3. Via Tol Trans Jawa:
Jakarta – Semarang – Solo – Sragen – Madiun – Mojokerto – Surabaya
Jakarta – Tegal – Pekalongan – Semarang – Solo – Ngawi – Surabaya
Jakarta – Cilacap (via Jalur Selatan)
Jakarta – Bandung – Garut – Tasikmalaya – Banjar – Ciamis – Cilacap